解決済み。Splash Screen イメージを指定すればいいだけでした。お恥ずかしいw
Visual Studio で iOS プロジェクトを作成すると 4inch Simulator/実機で 3.5inch 表示になってしまう (解決済み小ネタ) - Xamarin 日本語情報
Visual Studio で HelloWorld Application のテンプレートから作成したプロジェクトをデバッグすると、以下のように 3.5-inch、4-inch の選択ができず、強制的に Mac 側で iPhone Retina (3.5-inch) のシミュレーターが起動して 4-inch シミュレーターでのデバッグができないようです。
Why won't my iOS app deploy to the Simulator as a 4inch app? - xamarin
を見る限り、最新の Beta/Alpha で直ってるようなことが書いてありますので、Visual Studio 2013 と Xamarin.iOS for Visual Studio 1.10.30.0、Mac 側は最新の Xamarin.iOS 7.0.6.168 の環境で確認しましたが、まだ直っていないようです。*1
iPhone Retina 4-inch で実行するだけであれば デバッグ終了後、iOSシミュレーターのメニューから 「ハードウェア」-「デバイス」-「iPhone Retina (4-inch)」を選択して、アプリを起動すれば良いのですが…
または、プロジェクトを Mac に持っていって Xamarin Studio で開けば、問題なく iOSシミュレーターで問題なくデバッグ出来ます。*2
修正が期待されます。